অটোফ্যাগিতে কোষের পুরোনো বা ক্ষতিগ্রস্ত অঙ্গাণু লাইসোসোমের এনজাইম দ্বারা ভাঙা হয়। তাই লাইসোসোমকে কোষের পরিপাক অঙ্গাণু বলা হয়।